Instytut Nauk Medycznych UKSW prowadzi bogatą działalność na wielu polach naukowych. Owocem działalności badawczej Instytutu są liczne publikacje oraz występy naukowców na konferencjach krajowych i zagranicznych. Tematyka prowadzonych badań i publikacji jest zróżnicowana. Naukowcy zatrudnieni w Instytucie wykazują szczególną aktywność na polach ginekologii i położnictwa, kardiologii, chorób cywilizacyjnych, biochemii oraz parazytologii. Wiele uwagi poświęcone jest również zagadnieniom organizacji ochrony zdrowia i jakości kształcenia na kierunkach medycznych w Polsce.
W ramach Instytutu prowadzone są przedkliniczne badania laboratoryjne oraz badania z udziałem ochotników i pacjentów, a także badania wśród studentów i pracowników ochrony zdrowia. Szczególną wartością prac prowadzonych w Instytucie jest istotny wkład naukowy studentów w większości prowadzonych badań naukowych.
Rosnące zaplecze kliniczne WMCM UKSW pozwala Instytutowi na prowadzenie współpracy z licznymi instytutami naukowo-badawczymi.